Protein–RNA interactions for Protein: B2RTY4

MYO9A, Unconventional myosin-IXa, humanhuman

Predictions only

Length 2,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO9AB2RTY4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MYO9AB2RTY4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYO9AB2RTY4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYO9AB2RTY4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYO9AB2RTY4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYO9AB2RTY4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYO9AB2RTY4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYO9AB2RTY4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYO9AB2RTY4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYO9AB2RTY4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYO9AB2RTY4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYO9AB2RTY4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYO9AB2RTY4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYO9AB2RTY4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYO9AB2RTY4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYO9AB2RTY4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYO9AB2RTY4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYO9AB2RTY4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYO9AB2RTY4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYO9AB2RTY4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYO9AB2RTY4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYO9AB2RTY4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYO9AB2RTY4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYO9AB2RTY4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO9AB2RTY4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO9AB2RTY4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYO9AB2RTY4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO9AB2RTY4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO9AB2RTY4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO9AB2RTY4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO9AB2RTY4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO9AB2RTY4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYO9AB2RTY4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYO9AB2RTY4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYO9AB2RTY4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYO9AB2RTY4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYO9AB2RTY4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYO9AB2RTY4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYO9AB2RTY4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYO9AB2RTY4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MYO9AB2RTY4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYO9AB2RTY4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYO9AB2RTY4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYO9AB2RTY4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYO9AB2RTY4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYO9AB2RTY4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYO9AB2RTY4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYO9AB2RTY4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYO9AB2RTY4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MYO9AB2RTY4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYO9AB2RTY4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYO9AB2RTY4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYO9AB2RTY4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYO9AB2RTY4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYO9AB2RTY4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYO9AB2RTY4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MYO9AB2RTY4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYO9AB2RTY4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MYO9AB2RTY4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYO9AB2RTY4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYO9AB2RTY4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYO9AB2RTY4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYO9AB2RTY4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYO9AB2RTY4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYO9AB2RTY4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYO9AB2RTY4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MYO9AB2RTY4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MYO9AB2RTY4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms