Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KLF12Q9Y4X4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms