Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD1Q15797 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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