Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
EEA1Q15075 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC34.52■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
EEA1Q15075 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC34.48■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
EEA1Q15075 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
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