Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGHV1-8P0DP01 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IGHV1-8P0DP01 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV1-8P0DP01 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV1-8P0DP01 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV1-8P0DP01 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV1-8P0DP01 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV1-8P0DP01 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV1-8P0DP01 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV1-8P0DP01 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV1-8P0DP01 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV1-8P0DP01 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV1-8P0DP01 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV1-8P0DP01 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV1-8P0DP01 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV1-8P0DP01 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV1-8P0DP01 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV1-8P0DP01 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV1-8P0DP01 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV1-8P0DP01 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV1-8P0DP01 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV1-8P0DP01 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV1-8P0DP01 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV1-8P0DP01 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGHV1-8P0DP01 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHV1-8P0DP01 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGHV1-8P0DP01 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms