Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3KRW8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3KRW8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3KRW8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3KRW8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3KRW8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3KRW8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
J3KRW8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
J3KRW8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3KRW8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3KRW8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3KRW8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3KRW8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3KRW8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3KRW8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3KRW8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3KRW8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3KRW8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KRW8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KRW8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KRW8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KRW8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KRW8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KRW8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KRW8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KRW8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KRW8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KRW8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KRW8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KRW8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KRW8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KRW8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KRW8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KRW8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KRW8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KRW8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KRW8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KRW8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KRW8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KRW8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KRW8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KRW8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KRW8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3KRW8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KRW8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KRW8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KRW8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KRW8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KRW8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KRW8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KRW8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KRW8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KRW8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KRW8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KRW8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KRW8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KRW8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KRW8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KRW8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KRW8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KRW8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KRW8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KRW8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KRW8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KRW8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KRW8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KRW8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KRW8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KRW8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3KRW8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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