Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 PSMA2-203ENST00000436986 1453 ntTSL 39.11□□□□□ -0.952e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 PSMA2-205ENST00000457444 801 ntTSL 38.28□□□□□ -1.082e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 PSMA2-204ENST00000445517 683 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.152e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 CEP85-208ENST00000491670 941 ntTSL 27□□□□□ -1.292e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 UBE2D2-206ENST00000510470 256 ntTSL 26.96□□□□□ -1.32e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 PRC1-217ENST00000560423 755 ntTSL 36.38□□□□□ -1.394e-14■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 PRC1-210ENST00000556972 728 ntTSL 55.98□□□□□ -1.454e-14■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 NCKAP1-205ENST00000478449 713 ntTSL 35.02□□□□□ -1.612e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.642e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 KIAA1324L-206ENST00000427812 567 ntTSL 33.29□□□□□ -1.882e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 NCKAP1-203ENST00000471640 306 ntTSL 51.96□□□□□ -2.12e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 TMEM56-204ENST00000463375 349 ntTSL 50.48□□□□□ -2.332e-7■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 TBC1D16-208ENST00000574427 683 ntTSL 219.32■□□□□ 0.682e-6■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 TBC1D16-206ENST00000573782 685 ntTSL 316.01■□□□□ 0.152e-6■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 TBC1D16-207ENST00000574241 770 ntTSL 314.68□□□□□ -0.062e-6■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 HP1BP3-207ENST00000419948 759 ntTSL 54.35□□□□□ -1.714e-37■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 ATP5A1-216ENST00000591267 460 ntTSL 520.43■□□□□ 0.862e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 ATP5A1-207ENST00000588390 556 ntTSL 1 (best)18.34■□□□□ 0.532e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.352e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.082e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 ATP5A1-217ENST00000591981 565 ntTSL 414.02□□□□□ -0.172e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 AC012313.3-203ENST00000596636 436 ntTSL 513.88□□□□□ -0.192e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 ATP5A1-219ENST00000592989 553 ntTSL 510.19□□□□□ -0.782e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 WWP1-203ENST00000518683 2002 ntTSL 1 (best)6.9□□□□□ -1.32e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 ATP5A1-203ENST00000585650 520 ntTSL 55.86□□□□□ -1.472e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 SLC13A5-204ENST00000570687 419 ntTSL 33.11□□□□□ -1.911e-15■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.032e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 CNOT11-203ENST00000462489 572 ntTSL 22.34□□□□□ -2.032e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 SLC6A6-201ENST00000452151 284 ntTSL 56.32□□□□□ -1.41e-9■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 SDCCAG3-211ENST00000486441 570 ntTSL 513.1□□□□□ -0.315e-6■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 SLC39A14-205ENST00000517370 839 ntTSL 312.87□□□□□ -0.352e-22■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 HBG2-201ENST00000336906 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.883e-18■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.283e-18■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 NEU4-216ENST00000494678 491 ntTSL 418.77■□□□□ 0.63e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 CFB-278ENST00000472581 1059 ntTSL 215.13■□□□□ 0.013e-21■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 CFB-279ENST00000475617 586 ntTSL 47.5□□□□□ -1.213e-21■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.413e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.833e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 FASTKD1-206ENST00000487293 681 ntTSL 22.13□□□□□ -2.073e-8■□□□□ 8.6
EFTUD2Q15029 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.831e-11■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 FAM96B-202ENST00000562362 713 ntTSL 320.87■□□□□ 0.933e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 MAP3K11-213ENST00000534432 664 ntTSL 317.92■□□□□ 0.463e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 DDX27-202ENST00000462328 824 ntTSL 515.87■□□□□ 0.133e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 FAM96B-203ENST00000563490 718 ntTSL 214.59□□□□□ -0.073e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 FAM96B-204ENST00000567511 696 ntTSL 513.21□□□□□ -0.293e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 ATP5G1-210ENST00000515060 433 ntTSL 312.83□□□□□ -0.363e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 PCSK6-204ENST00000558154 852 ntTSL 212.14□□□□□ -0.473e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 FAM96B-205ENST00000568572 446 ntTSL 510.72□□□□□ -0.693e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 ATP5G1-205ENST00000504591 401 ntTSL 210.05□□□□□ -0.83e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 MAT1A-202ENST00000455001 435 ntTSL 510.01□□□□□ -0.813e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 ATP5G1-203ENST00000502964 679 ntTSL 210□□□□□ -0.813e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 MAT1A-201ENST00000372213 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -13e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 MAP3K11-205ENST00000526647 582 ntTSL 37.94□□□□□ -1.143e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.153e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 USP10-214ENST00000567526 330 ntTSL 35.83□□□□□ -1.483e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 NGDN-206ENST00000556022 999 ntTSL 25.55□□□□□ -1.523e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 USP10-217ENST00000569925 572 ntTSL 35.53□□□□□ -1.523e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 NGDN-210ENST00000556580 629 ntTSL 25.46□□□□□ -1.543e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 FXR1-217ENST00000484042 562 ntTSL 44.31□□□□□ -1.723e-6■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 TMEM74B-203ENST00000481747 582 ntTSL 226.77■■□□□ 1.885e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 SOD2-212ENST00000540491 454 ntTSL 317.94■□□□□ 0.465e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 L3MBTL1-209ENST00000439769 460 ntTSL 416.97■□□□□ 0.315e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 ASMTL-AS1-204ENST00000443929 574 ntTSL 215.59■□□□□ 0.095e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 ARHGEF17-203ENST00000536481 697 ntTSL 213.52□□□□□ -0.255e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 RALGAPA2-206ENST00000620717 1432 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.615e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 PTBP2-205ENST00000460706 1129 ntTSL 210.69□□□□□ -0.75e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 BTN3A1-206ENST00000450085 580 ntTSL 49.71□□□□□ -0.865e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 CERK-204ENST00000471929 567 ntTSL 49.65□□□□□ -0.865e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 RALGAPA2-204ENST00000430436 8769 ntTSL 58.99□□□□□ -0.975e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 GABRE-207ENST00000476016 813 ntTSL 48.18□□□□□ -1.15e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 BTN3A1-210ENST00000506698 619 ntTSL 48.13□□□□□ -1.115e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 TCEA3-205ENST00000476978 855 ntTSL 36.69□□□□□ -1.345e-13■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 BTN3A1-207ENST00000465690 584 ntTSL 44.66□□□□□ -1.665e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 BTN3A1-205ENST00000427334 570 ntTSL 43.94□□□□□ -1.785e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 GABRE-206ENST00000474932 430 ntTSL 52.27□□□□□ -2.055e-7■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 SSX2IP-202ENST00000422026 759 ntTSL 314.44□□□□□ -0.14e-10■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 SRPK1-207ENST00000505885 566 ntTSL 22.89□□□□□ -1.954e-10■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 EIF4G2-227ENST00000533485 806 ntTSL 27.11□□□□□ -1.275e-9■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 ETF1-202ENST00000499810 3874 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.382e-10■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 ETF1-201ENST00000360541 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.492e-10■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 EZH1-204ENST00000585550 1643 ntTSL 1 (best)9.56□□□□□ -0.882e-10■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.32e-10■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 ZNF638-218ENST00000486494 973 ntTSL 25.21□□□□□ -1.582e-15■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 STRN3-204ENST00000554124 785 ntTSL 43.2□□□□□ -1.92e-12■□□□□ 8.5
EFTUD2Q15029 MIER1-210ENST00000479067 745 ntTSL 54.05□□□□□ -1.763e-7■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.22e-9■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 FANCA-222ENST00000567205 413 ntTSL 1 (best)15.69■□□□□ 0.12e-9■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.022e-9■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 FAM219B-210ENST00000564723 208 ntTSL 27.76□□□□□ -1.172e-9■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 SPPL2A-204ENST00000558934 1422 ntTSL 57.56□□□□□ -1.22e-9■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 SPPL2A-206ENST00000559527 899 ntTSL 55.97□□□□□ -1.452e-9■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 SPPL2A-205ENST00000559293 419 ntTSL 33.26□□□□□ -1.892e-9■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 TFRC-213ENST00000482479 540 ntTSL 33.61□□□□□ -1.832e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.55e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 ZNF292-203ENST00000369578 1732 ntTSL 217.45■□□□□ 0.385e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 DBN1-205ENST00000471767 428 ntTSL 516.94■□□□□ 0.35e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.275e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.175e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.085e-8■□□□□ 8.4
EFTUD2Q15029 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.195e-8■□□□□ 8.4
Retrieved 100 of 48,698 protein–RNA pairs in 3419 ms