RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486441.1

SDCCAG3-211, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 5

Gene SDCCAG3, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SDCCAG3-211ENST00000486441 SMARCA2P51531 1590 aa28.36■■■□□ 2.13
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SDCCAG3-211ENST00000486441 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.44■■□□□ 1.98
SDCCAG3-211ENST00000486441 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.44■■□□□ 1.98
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SDCCAG3-211ENST00000486441 ARHGEF11O15085 1522 aa26.77■■□□□ 1.88
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SDCCAG3-211ENST00000486441 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.57■■□□□ 1.84
SDCCAG3-211ENST00000486441 CHD1O14646 1710 aa26.55■■□□□ 1.84
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SDCCAG3-211ENST00000486441 CUX1P39880 1505 aa26.37■■□□□ 1.81
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SDCCAG3-211ENST00000486441 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.33■■□□□ 1.81
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SDCCAG3-211ENST00000486441 GRIN2BQ13224 1484 aa26.26■■□□□ 1.79
SDCCAG3-211ENST00000486441 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
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SDCCAG3-211ENST00000486441 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.04■■□□□ 1.76
SDCCAG3-211ENST00000486441 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.96■■□□□ 1.75
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SDCCAG3-211ENST00000486441 NUP160Q12769 1436 aa25.9■■□□□ 1.74
SDCCAG3-211ENST00000486441 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.9■■□□□ 1.74
SDCCAG3-211ENST00000486441 CEP170Q5SW79 1584 aa25.86■■□□□ 1.73
SDCCAG3-211ENST00000486441 ADAMTS12P58397 1594 aa25.85■■□□□ 1.73
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SDCCAG3-211ENST00000486441 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.8■■□□□ 1.72
SDCCAG3-211ENST00000486441 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.8■■□□□ 1.72
SDCCAG3-211ENST00000486441 SHROOM2Q13796 1616 aa25.77■■□□□ 1.72
SDCCAG3-211ENST00000486441 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.72■■□□□ 1.71
SDCCAG3-211ENST00000486441 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
SDCCAG3-211ENST00000486441 JPH4Q96JJ6 628 aa25.65■■□□□ 1.7
SDCCAG3-211ENST00000486441 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
SDCCAG3-211ENST00000486441 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.54■■□□□ 1.68
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