Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I4

PCDHAC2, Protocadherin alpha-C2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHAC2Q9Y5I4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCDHAC2Q9Y5I4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHAC2Q9Y5I4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHAC2Q9Y5I4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHAC2Q9Y5I4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHAC2Q9Y5I4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHAC2Q9Y5I4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHAC2Q9Y5I4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHAC2Q9Y5I4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHAC2Q9Y5I4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHAC2Q9Y5I4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms