Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLF12Q9Y4X4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms