Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK12Q9NYV4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CDK12Q9NYV4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms