Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASS4Q9NQ75 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASS4Q9NQ75 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms