Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BEST4Q8NFU0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEST4Q8NFU0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms