Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
CNTD1Q8N815 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTD1Q8N815 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms