Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ME3Q16798 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME3Q16798 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME3Q16798 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME3Q16798 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME3Q16798 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME3Q16798 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME3Q16798 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME3Q16798 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME3Q16798 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME3Q16798 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME3Q16798 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME3Q16798 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME3Q16798 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME3Q16798 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME3Q16798 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME3Q16798 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME3Q16798 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME3Q16798 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME3Q16798 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME3Q16798 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME3Q16798 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME3Q16798 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ME3Q16798 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ME3Q16798 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ME3Q16798 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ME3Q16798 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ME3Q16798 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ME3Q16798 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ME3Q16798 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ME3Q16798 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ME3Q16798 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ME3Q16798 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ME3Q16798 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ME3Q16798 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ME3Q16798 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ME3Q16798 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME3Q16798 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME3Q16798 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME3Q16798 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME3Q16798 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ME3Q16798 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME3Q16798 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME3Q16798 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME3Q16798 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME3Q16798 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME3Q16798 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME3Q16798 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME3Q16798 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME3Q16798 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME3Q16798 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME3Q16798 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME3Q16798 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME3Q16798 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME3Q16798 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME3Q16798 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME3Q16798 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME3Q16798 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME3Q16798 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME3Q16798 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME3Q16798 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ME3Q16798 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME3Q16798 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ME3Q16798 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME3Q16798 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME3Q16798 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME3Q16798 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME3Q16798 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME3Q16798 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME3Q16798 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME3Q16798 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME3Q16798 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ME3Q16798 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME3Q16798 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ME3Q16798 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME3Q16798 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME3Q16798 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME3Q16798 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME3Q16798 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME3Q16798 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME3Q16798 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME3Q16798 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME3Q16798 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME3Q16798 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME3Q16798 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME3Q16798 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME3Q16798 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME3Q16798 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME3Q16798 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME3Q16798 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME3Q16798 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME3Q16798 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME3Q16798 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME3Q16798 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME3Q16798 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME3Q16798 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME3Q16798 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ME3Q16798 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ME3Q16798 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ME3Q16798 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
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