Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIF1AQ16665 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIF1AQ16665 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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