Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS1P54277 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS1P54277 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS1P54277 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS1P54277 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS1P54277 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS1P54277 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS1P54277 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS1P54277 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS1P54277 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS1P54277 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS1P54277 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS1P54277 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS1P54277 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS1P54277 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS1P54277 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS1P54277 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS1P54277 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS1P54277 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS1P54277 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS1P54277 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS1P54277 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PMS1P54277 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMS1P54277 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMS1P54277 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMS1P54277 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMS1P54277 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMS1P54277 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMS1P54277 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMS1P54277 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMS1P54277 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMS1P54277 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMS1P54277 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMS1P54277 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMS1P54277 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS1P54277 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS1P54277 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS1P54277 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS1P54277 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS1P54277 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS1P54277 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS1P54277 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS1P54277 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS1P54277 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS1P54277 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PMS1P54277 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS1P54277 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS1P54277 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS1P54277 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS1P54277 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS1P54277 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS1P54277 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS1P54277 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS1P54277 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS1P54277 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS1P54277 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS1P54277 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS1P54277 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS1P54277 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PMS1P54277 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS1P54277 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS1P54277 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS1P54277 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS1P54277 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS1P54277 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS1P54277 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS1P54277 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS1P54277 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS1P54277 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS1P54277 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS1P54277 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS1P54277 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS1P54277 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS1P54277 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS1P54277 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS1P54277 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS1P54277 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS1P54277 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS1P54277 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS1P54277 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS1P54277 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PMS1P54277 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMS1P54277 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMS1P54277 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMS1P54277 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMS1P54277 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMS1P54277 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMS1P54277 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMS1P54277 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMS1P54277 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMS1P54277 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMS1P54277 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMS1P54277 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMS1P54277 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMS1P54277 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMS1P54277 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMS1P54277 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMS1P54277 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMS1P54277 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMS1P54277 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms