Protein–RNA interactions for Protein: P53805

RCAN1, Calcipressin-1, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN1P53805 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCAN1P53805 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RCAN1P53805 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RCAN1P53805 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.3 ms