Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RXRAP19793 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RXRAP19793 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RXRAP19793 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RXRAP19793 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RXRAP19793 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RXRAP19793 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RXRAP19793 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RXRAP19793 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RXRAP19793 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RXRAP19793 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RXRAP19793 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RXRAP19793 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RXRAP19793 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RXRAP19793 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RXRAP19793 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RXRAP19793 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RXRAP19793 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RXRAP19793 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RXRAP19793 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RXRAP19793 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RXRAP19793 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RXRAP19793 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RXRAP19793 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RXRAP19793 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RXRAP19793 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RXRAP19793 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RXRAP19793 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RXRAP19793 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RXRAP19793 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RXRAP19793 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RXRAP19793 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RXRAP19793 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RXRAP19793 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RXRAP19793 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RXRAP19793 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RXRAP19793 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RXRAP19793 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RXRAP19793 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RXRAP19793 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RXRAP19793 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RXRAP19793 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RXRAP19793 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RXRAP19793 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RXRAP19793 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RXRAP19793 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RXRAP19793 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RXRAP19793 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RXRAP19793 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RXRAP19793 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RXRAP19793 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RXRAP19793 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RXRAP19793 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RXRAP19793 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RXRAP19793 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RXRAP19793 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RXRAP19793 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RXRAP19793 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RXRAP19793 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RXRAP19793 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RXRAP19793 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RXRAP19793 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RXRAP19793 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RXRAP19793 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RXRAP19793 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RXRAP19793 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RXRAP19793 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RXRAP19793 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RXRAP19793 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RXRAP19793 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RXRAP19793 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RXRAP19793 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RXRAP19793 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RXRAP19793 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RXRAP19793 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RXRAP19793 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RXRAP19793 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RXRAP19793 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RXRAP19793 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RXRAP19793 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RXRAP19793 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RXRAP19793 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RXRAP19793 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RXRAP19793 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RXRAP19793 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RXRAP19793 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RXRAP19793 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RXRAP19793 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RXRAP19793 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RXRAP19793 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RXRAP19793 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RXRAP19793 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RXRAP19793 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RXRAP19793 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RXRAP19793 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RXRAP19793 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RXRAP19793 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RXRAP19793 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RXRAP19793 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RXRAP19793 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms