Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SEMA3CQ99985 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEMA3CQ99985 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms