Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC47Q96A33 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC47Q96A33 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
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