Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ3

NLGN4Y, Neuroligin-4, Y-linked, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4YQ8NFZ3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLGN4YQ8NFZ3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NLGN4YQ8NFZ3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN4YQ8NFZ3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms