Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RSBN1Q5VWQ0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RSBN1Q5VWQ0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms