Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDKN3Q16667 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms