Protein–RNA interactions for Protein: Q03702

CCE1, Cruciform cutting endonuclease 1, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCE1Q03702 GIS2YNL255C 462 nt3.09□□□□□ -1.91
CCE1Q03702 FDH2YPL275W 711 nt3.09□□□□□ -1.91
CCE1Q03702 NSP1YJL041W 2472 nt3.09□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 ECM11YDR446W 909 nt3.08□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 YDR491CYDR491C 492 nt3.08□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 PBA1YLR199C 831 nt3.08□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 BUR2YLR226W 1188 nt3.08□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 RAD33YML011C 534 nt3.08□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 TEM1YML064C 738 nt3.08□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt3.08□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 PPT2YPL148C 522 nt3.08□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 EBS1YDR206W 2655 nt3.08□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 SLY41YOR307C 1362 nt3.08□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 CDC5YMR001C 2118 nt3.08□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 ALG8YOR067C 1734 nt3.07□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 SEC27YGL137W 2670 nt3.07□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 ENA2YDR039C 3276 nt3.07□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 ENA1YDR040C 3276 nt3.07□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 ATP16YDL004W 483 nt3.07□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 TGL2YDR058C 981 nt3.07□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 HTB1YDR224C 396 nt3.07□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 VFA1YER128W 612 nt3.07□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 CGR1YGL029W 363 nt3.07□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 YHL026CYHL026C 948 nt3.07□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 YHR097CYHR097C 1101 nt3.07□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt3.07□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 RPC25YKL144C 639 nt3.07□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 YMR087WYMR087W 855 nt3.07□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 CUP9YPL177C 921 nt3.07□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 DYN1YKR054C 12279 nt3.07□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 VPS30YPL120W 1674 nt3.07□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 CHA4YLR098C 1947 nt3.07□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 SAG1YJR004C 1953 nt3.07□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 HDA2YDR295C 2025 nt3.07□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 FRE4YNR060W 2160 nt3.07□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 CDC40YDR364C 1368 nt3.06□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 GUK1YDR454C 564 nt3.06□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 CWC23YGL128C 852 nt3.06□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 SCM4YGR049W 564 nt3.06□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 YJL175WYJL175W 513 nt3.06□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 YKT6YKL196C 603 nt3.06□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 COQ9YLR201C 783 nt3.06□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 SMD2YLR275W 333 nt3.06□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt3.06□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 PIN4YBL051C 2007 nt3.06□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 HUA2YOR284W 732 nt3.06□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 YDL176WYDL176W 2127 nt3.05□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 YGL176CYGL176C 1665 nt3.05□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 YCR099CYCR099C 468 nt3.05□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.05□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.05□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt3.05□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt3.05□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.05□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.05□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 MPS2YGL075C 1164 nt3.05□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 YGR107WYGR107W 450 nt3.05□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 RGI2YIL057C 495 nt3.05□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 YJR037WYJR037W 384 nt3.05□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 APC9YLR102C 798 nt3.05□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 TVP18YMR071C 504 nt3.05□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 MIC27YNL100W 705 nt3.05□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 LDS2YOL047C 1071 nt3.05□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 snR11snR11 258 nt3.05□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 GRX5YPL059W 453 nt3.05□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 MDM1YML104C 3384 nt3.05□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 MTR4YJL050W 3222 nt3.05□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 UTP5YDR398W 1932 nt3.05□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 RIF1YBR275C 5751 nt3.05□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 RGC1YPR115W 3252 nt3.04□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt3.04□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 PIR1YKL164C 1026 nt3.04□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 ERP1YAR002C-A 660 nt3.04□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 RLP7YNL002C 969 nt3.04□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 YDR089WYDR089W 2610 nt3.04□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 MIG1YGL035C 1515 nt3.03□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 FAS1YKL182W 6156 nt3.03□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 YDL158CYDL158C 309 nt3.03□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 FRQ1YDR373W 573 nt3.03□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 YFL065CYFL065C 309 nt3.03□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt3.03□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 MER1YNL210W 813 nt3.03□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 YOR238WYOR238W 912 nt3.03□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 MIT1YEL007W 2001 nt3.03□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 YEL025CYEL025C 3567 nt3.03□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 STP1YDR463W 1560 nt3.03□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 CIN8YEL061C 3003 nt3.03□□□□□ -1.92
CCE1Q03702 FLO9YAL063C 3969 nt3.02□□□□□ -1.93
CCE1Q03702 PFK26YIL107C 2484 nt3.02□□□□□ -1.93
CCE1Q03702 PCI8YIL071C 1335 nt3.02□□□□□ -1.93
CCE1Q03702 YDR149CYDR149C 708 nt3.02□□□□□ -1.93
CCE1Q03702 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.02□□□□□ -1.93
CCE1Q03702 SPT2YER161C 1002 nt3.02□□□□□ -1.93
CCE1Q03702 YGL214WYGL214W 486 nt3.02□□□□□ -1.93
CCE1Q03702 RPL17AYKL180W 555 nt3.02□□□□□ -1.93
CCE1Q03702 RPS21AYKR057W 264 nt3.02□□□□□ -1.93
CCE1Q03702 BET5YML077W 480 nt3.02□□□□□ -1.93
CCE1Q03702 MRPL16YBL038W 699 nt3.02□□□□□ -1.93
CCE1Q03702 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt3.02□□□□□ -1.93
CCE1Q03702 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.8 ms