Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEFLP07196 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEFLP07196 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEFLP07196 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEFLP07196 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEFLP07196 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEFLP07196 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEFLP07196 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEFLP07196 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEFLP07196 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEFLP07196 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEFLP07196 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEFLP07196 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEFLP07196 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEFLP07196 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEFLP07196 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEFLP07196 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEFLP07196 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEFLP07196 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NEFLP07196 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEFLP07196 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEFLP07196 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEFLP07196 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEFLP07196 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NEFLP07196 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEFLP07196 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NEFLP07196 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NEFLP07196 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEFLP07196 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEFLP07196 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEFLP07196 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEFLP07196 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEFLP07196 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEFLP07196 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEFLP07196 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEFLP07196 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEFLP07196 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NEFLP07196 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEFLP07196 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEFLP07196 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEFLP07196 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEFLP07196 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEFLP07196 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEFLP07196 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEFLP07196 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEFLP07196 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEFLP07196 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEFLP07196 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEFLP07196 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEFLP07196 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEFLP07196 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEFLP07196 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEFLP07196 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEFLP07196 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEFLP07196 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEFLP07196 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEFLP07196 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEFLP07196 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEFLP07196 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEFLP07196 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEFLP07196 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEFLP07196 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEFLP07196 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEFLP07196 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NEFLP07196 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
NEFLP07196 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFLP07196 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFLP07196 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFLP07196 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFLP07196 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFLP07196 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFLP07196 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFLP07196 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFLP07196 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFLP07196 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFLP07196 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFLP07196 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFLP07196 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFLP07196 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFLP07196 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NEFLP07196 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFLP07196 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFLP07196 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFLP07196 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFLP07196 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFLP07196 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFLP07196 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEFLP07196 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEFLP07196 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEFLP07196 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NEFLP07196 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEFLP07196 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEFLP07196 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEFLP07196 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEFLP07196 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEFLP07196 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NEFLP07196 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEFLP07196 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEFLP07196 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEFLP07196 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms