Protein–RNA interactions for Protein: O75113

N4BP1, NEDD4-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP1O75113 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
N4BP1O75113 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
N4BP1O75113 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms