Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2X4

PID1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PID1Q7Z2X4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PID1Q7Z2X4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PID1Q7Z2X4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PID1Q7Z2X4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PID1Q7Z2X4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PID1Q7Z2X4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PID1Q7Z2X4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PID1Q7Z2X4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PID1Q7Z2X4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PID1Q7Z2X4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PID1Q7Z2X4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PID1Q7Z2X4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PID1Q7Z2X4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PID1Q7Z2X4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PID1Q7Z2X4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PID1Q7Z2X4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PID1Q7Z2X4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PID1Q7Z2X4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PID1Q7Z2X4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PID1Q7Z2X4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PID1Q7Z2X4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PID1Q7Z2X4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PID1Q7Z2X4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PID1Q7Z2X4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PID1Q7Z2X4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PID1Q7Z2X4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PID1Q7Z2X4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PID1Q7Z2X4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PID1Q7Z2X4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PID1Q7Z2X4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PID1Q7Z2X4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms