Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRSAM1Q6UWE0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRSAM1Q6UWE0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms