Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

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Length 1,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 LCB2YDR062W 1686 nt6.45□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 SMF2YHR050W 1650 nt6.45□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 NOT5YPR072W 1683 nt6.45□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 YNL095CYNL095C 1929 nt6.45□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 ISC1YER019W 1434 nt6.45□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 IGO2YHR132W-A 396 nt6.45□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt6.45□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 snR49snR49 165 nt6.45□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 YJL016WYJL016W 1686 nt6.45□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 HRD1YOL013C 1656 nt6.45□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 VBA2YBR293W 1425 nt6.44□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 YDL068WYDL068W 330 nt6.44□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 RMP1YLR145W 606 nt6.44□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 HAP3YBL021C 435 nt6.44□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 YBR090CYBR090C 369 nt6.44□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 SKI2YLR398C 3864 nt6.44□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 KAR9YPL269W 1935 nt6.44□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 DBP3YGL078C 1572 nt6.44□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 ULA1YPL003W 1389 nt6.44□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 MSE1YOL033W 1611 nt6.43□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 HXK2YGL253W 1461 nt6.43□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 YGR153WYGR153W 654 nt6.43□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 VHR1YIL056W 1923 nt6.42□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 PUF3YLL013C 2640 nt6.42□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 TOG1YER184C 2385 nt6.42□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 GPI8YDR331W 1236 nt6.42□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 HIS5YIL116W 1158 nt6.42□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 AAD15YOL165C 432 nt6.42□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 DAD3YBR233W-A 285 nt6.42□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 CTT1YGR088W 1689 nt6.42□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 MCD1YDL003W 1701 nt6.42□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 VPS73YGL104C 1461 nt6.41□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 ASF2YDL197C 1578 nt6.41□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 PPM1YDR435C 987 nt6.41□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 TFB3YDR460W 966 nt6.41□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 RPL40AYIL148W 387 nt6.41□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt6.41□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 snR24snR24 89 nt6.41□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 VBA1YMR088C 1689 nt6.41□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 CET1YPL228W 1650 nt6.41□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 MDL1YLR188W 2088 nt6.41□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 PFK2YMR205C 2880 nt6.41□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 YDR109CYDR109C 2148 nt6.41□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 RTK1YDL025C 1863 nt6.41□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 FRS2YFL022C 1512 nt6.4□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 YLR152CYLR152C 1731 nt6.4□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 YDL211CYDL211C 1119 nt6.4□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 YNL150WYNL150W 408 nt6.4□□□□□ -1.38
NCR1Q12200 BUD7YOR299W 2241 nt6.4□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 snR82snR82 268 nt6.39□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 YFL064CYFL064C 525 nt6.39□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt6.39□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 RPS9AYPL081W 594 nt6.39□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 UBP9YER098W 2265 nt6.39□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 RPT1YKL145W 1404 nt6.39□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 APE3YBR286W 1614 nt6.39□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 CUE3YGL110C 1875 nt6.39□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 ORC2YBR060C 1863 nt6.39□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 TFB5YDR079C-A 219 nt6.38□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 EFM4YIL064W 774 nt6.38□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt6.38□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 SOL1YNR034W 966 nt6.38□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 ZEO1YOL109W 342 nt6.38□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 GWT1YJL091C 1473 nt6.38□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 PDR18YNR070W 4002 nt6.37□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 MCP2YLR253W 1710 nt6.37□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 COX1Q0045 1605 nt6.37□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 STP2YHR006W 1626 nt6.37□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 PCS60YBR222C 1632 nt6.37□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 SPC19YDR201W 498 nt6.37□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 SMD1YGR074W 441 nt6.37□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 RPL8BYLL045C 771 nt6.37□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 UBC7YMR022W 498 nt6.37□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 MCM3YEL032W 2916 nt6.37□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 FAA4YMR246W 2085 nt6.37□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 TEF1YPR080W 1377 nt6.36□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 TEF2YBR118W 1377 nt6.36□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 YCR007CYCR007C 720 nt6.36□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 YHR097CYHR097C 1101 nt6.36□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt6.36□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt6.36□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 SEC17YBL050W 879 nt6.36□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 MRPS12YNR036C 462 nt6.36□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 IME2YJL106W 1938 nt6.36□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 YLL032CYLL032C 2478 nt6.36□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 YDR344CYDR344C 444 nt6.35□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 SUP19tS(UGA)E 82 nt6.35□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 SUP17tS(UGA)I 82 nt6.35□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 SUP16tS(UGA)P 82 nt6.35□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt6.35□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 HSK3YKL138C-A 210 nt6.35□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 YOL036WYOL036W 2286 nt6.35□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 GPI10YGL142C 1851 nt6.34□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 YIL055CYIL055C 1884 nt6.34□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 RAD52YML032C 1416 nt6.34□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 VHT1YGR065C 1782 nt6.34□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 HAP4YKL109W 1665 nt6.34□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt6.34□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 RPL17BYJL177W 555 nt6.34□□□□□ -1.39
NCR1Q12200 KTR5YNL029C 1569 nt6.34□□□□□ -1.39
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