Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ABCE1P61221 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ABCE1P61221 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms