Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPB1P53618 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPB1P53618 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPB1P53618 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPB1P53618 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPB1P53618 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPB1P53618 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPB1P53618 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPB1P53618 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPB1P53618 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB1P53618 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB1P53618 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB1P53618 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB1P53618 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB1P53618 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB1P53618 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB1P53618 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB1P53618 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB1P53618 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB1P53618 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB1P53618 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB1P53618 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB1P53618 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB1P53618 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB1P53618 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB1P53618 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB1P53618 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB1P53618 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB1P53618 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB1P53618 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB1P53618 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB1P53618 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB1P53618 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB1P53618 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB1P53618 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB1P53618 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB1P53618 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB1P53618 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB1P53618 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB1P53618 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB1P53618 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB1P53618 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB1P53618 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPB1P53618 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPB1P53618 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPB1P53618 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPB1P53618 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPB1P53618 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
COPB1P53618 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPB1P53618 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPB1P53618 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPB1P53618 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB1P53618 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB1P53618 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB1P53618 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB1P53618 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB1P53618 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB1P53618 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB1P53618 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB1P53618 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB1P53618 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB1P53618 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB1P53618 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB1P53618 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB1P53618 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB1P53618 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB1P53618 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB1P53618 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB1P53618 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPB1P53618 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPB1P53618 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPB1P53618 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPB1P53618 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPB1P53618 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPB1P53618 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPB1P53618 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPB1P53618 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPB1P53618 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPB1P53618 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPB1P53618 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPB1P53618 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPB1P53618 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPB1P53618 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPB1P53618 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPB1P53618 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPB1P53618 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPB1P53618 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPB1P53618 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPB1P53618 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPB1P53618 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPB1P53618 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPB1P53618 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPB1P53618 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPB1P53618 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPB1P53618 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPB1P53618 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPB1P53618 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
COPB1P53618 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPB1P53618 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPB1P53618 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms