Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
KPNA2P52292 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KPNA2P52292 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms