Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ERCC5P28715 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERCC5P28715 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC5P28715 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms