Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3KRW8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3KRW8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
J3KRW8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3KRW8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3KRW8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3KRW8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3KRW8 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3KRW8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3KRW8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3KRW8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3KRW8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3KRW8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3KRW8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3KRW8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3KRW8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3KRW8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
J3KRW8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3KRW8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3KRW8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3KRW8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3KRW8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3KRW8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3KRW8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3KRW8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3KRW8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3KRW8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3KRW8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
J3KRW8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
J3KRW8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3KRW8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
J3KRW8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3KRW8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
J3KRW8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3KRW8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3KRW8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
J3KRW8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3KRW8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
J3KRW8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3KRW8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3KRW8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
J3KRW8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3KRW8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
J3KRW8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3KRW8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3KRW8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3KRW8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
J3KRW8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
J3KRW8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
J3KRW8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
J3KRW8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3KRW8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3KRW8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3KRW8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3KRW8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3KRW8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3KRW8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3KRW8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3KRW8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3KRW8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3KRW8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3KRW8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3KRW8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
J3KRW8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3KRW8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3KRW8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3KRW8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
J3KRW8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3KRW8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3KRW8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3KRW8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3KRW8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3KRW8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3KRW8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3KRW8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
J3KRW8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3KRW8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3KRW8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3KRW8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3KRW8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3KRW8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3KRW8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3KRW8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3KRW8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3KRW8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3KRW8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
J3KRW8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
J3KRW8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3KRW8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
J3KRW8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3KRW8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
J3KRW8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3KRW8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3KRW8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3KRW8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3KRW8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3KRW8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3KRW8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
J3KRW8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
J3KRW8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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