Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCTD3Q9Y597 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCTD3Q9Y597 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms