Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV5

RAPGEFL1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEFL1Q9UHV5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAPGEFL1Q9UHV5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAPGEFL1Q9UHV5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEFL1Q9UHV5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEFL1Q9UHV5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEFL1Q9UHV5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEFL1Q9UHV5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEFL1Q9UHV5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEFL1Q9UHV5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEFL1Q9UHV5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAPGEFL1Q9UHV5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEFL1Q9UHV5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEFL1Q9UHV5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEFL1Q9UHV5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAPGEFL1Q9UHV5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms