Protein–RNA interactions for Protein: Q92759

GTF2H4, General transcription factor IIH subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H4Q92759 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTF2H4Q92759 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2H4Q92759 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2H4Q92759 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2H4Q92759 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2H4Q92759 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GTF2H4Q92759 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H4Q92759 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H4Q92759 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H4Q92759 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H4Q92759 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GTF2H4Q92759 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms