Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PPARGC1BQ86YN6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PPARGC1BQ86YN6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PPARGC1BQ86YN6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms