Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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RRN3P1Q2M238 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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RRN3P1Q2M238 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RRN3P1Q2M238 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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