Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC18A3Q16572 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC18A3Q16572 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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