Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH18Q13634 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH18Q13634 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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