Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTP4A2Q12974 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTP4A2Q12974 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTP4A2Q12974 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
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