Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC63Q05C16 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC63Q05C16 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.4 ms