Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFLP07196 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFLP07196 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFLP07196 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFLP07196 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFLP07196 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFLP07196 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFLP07196 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFLP07196 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFLP07196 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFLP07196 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEFLP07196 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEFLP07196 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEFLP07196 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEFLP07196 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEFLP07196 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEFLP07196 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEFLP07196 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEFLP07196 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEFLP07196 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEFLP07196 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEFLP07196 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEFLP07196 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEFLP07196 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEFLP07196 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFLP07196 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFLP07196 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFLP07196 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFLP07196 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFLP07196 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFLP07196 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFLP07196 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFLP07196 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFLP07196 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFLP07196 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFLP07196 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFLP07196 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEFLP07196 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NEFLP07196 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEFLP07196 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEFLP07196 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEFLP07196 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEFLP07196 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEFLP07196 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEFLP07196 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEFLP07196 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEFLP07196 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEFLP07196 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEFLP07196 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEFLP07196 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEFLP07196 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NEFLP07196 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NEFLP07196 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEFLP07196 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEFLP07196 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEFLP07196 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEFLP07196 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NEFLP07196 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NEFLP07196 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEFLP07196 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
NEFLP07196 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEFLP07196 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NEFLP07196 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFLP07196 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFLP07196 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFLP07196 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFLP07196 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFLP07196 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFLP07196 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFLP07196 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFLP07196 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFLP07196 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFLP07196 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFLP07196 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFLP07196 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFLP07196 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFLP07196 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFLP07196 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFLP07196 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEFLP07196 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEFLP07196 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEFLP07196 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEFLP07196 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEFLP07196 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEFLP07196 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEFLP07196 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEFLP07196 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEFLP07196 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEFLP07196 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEFLP07196 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEFLP07196 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEFLP07196 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEFLP07196 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEFLP07196 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEFLP07196 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NEFLP07196 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEFLP07196 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEFLP07196 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEFLP07196 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEFLP07196 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms