Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LIPT2A6NK58 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LIPT2A6NK58 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LIPT2A6NK58 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LIPT2A6NK58 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIPT2A6NK58 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIPT2A6NK58 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIPT2A6NK58 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIPT2A6NK58 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIPT2A6NK58 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIPT2A6NK58 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIPT2A6NK58 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIPT2A6NK58 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIPT2A6NK58 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIPT2A6NK58 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIPT2A6NK58 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIPT2A6NK58 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIPT2A6NK58 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LIPT2A6NK58 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LIPT2A6NK58 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LIPT2A6NK58 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LIPT2A6NK58 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LIPT2A6NK58 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LIPT2A6NK58 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LIPT2A6NK58 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LIPT2A6NK58 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LIPT2A6NK58 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms