Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CFAP69A5D8W1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP69A5D8W1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP69A5D8W1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP69A5D8W1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFAP69A5D8W1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms