Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CASS4Q9NQ75 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CASS4Q9NQ75 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms