Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP30Q70CQ3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP30Q70CQ3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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