Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRIP3Q6Q6R5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CRIP3Q6Q6R5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms